Po śmierci pierwszej przewodniczącej jury Angelusa, Natalii Gorbaniewskiej, pozostali członkowie jury postanowili uczcić jej pamięć, ustanawiając nagrodę jej imienia. Jest to honorowe wyróżnienie dla jednej z siedmiu książek finałowych, którą wskaże publiczność. Po raz pierwszy Nagroda została przyznana w 2014 roku. Głosowanie odbywa się na stronie internetowej Angelusa.

Od 2020 roku laureatki i laureaci Nagrody im. Natalii Gorbaniewskiej są przez organizatora i fundatora Nagrody Angelus zapraszani na trzymiesięczne stypendium pisarskie we Wrocławiu.